統合マルチオミクス解析 クラウドデータ解析ソフトウェア CDIAM Multi-Omics Studio

CDIAM Multi-Omics Studioは、科学者がマルチオミクスデータを解析・統合し、生物学の全体像を明らかにするためのウェブプラットフォームです。
シングルセルおよび空間トランスクリプトミクスのデータ解析を主な目的として開発されています。様々なデータに対応する解析および視覚化手法を備えており、コマンドライン無しで多彩な解析を実行可能です。

• シングルセルRNA-Seq
• バルクRNA-seq
• 空間トランスクリプトミクス
• プロテオミクス
• メタボロミクス
• マルチオミクス比較

• 主な対応データ
  ・シングルセルRNA-seq、CITE-seq：10x h5、10x mtx、h5adファイル他
  ・Visium、Visium HD：10x h5、10x mtx、h5adファイル他
  ・バルクRNA-seq、プロテオミクス：tsv、txt、csvファイル他
  ・Xenium：10x h5、10x mtx、h5adファイル他
• CDIAM に登録済みの10000を超える公開データ
  即座に様々な種類や疾患などに関連するオミクスデータにアクセス可能
  ・シングルセルRNA-seq、CITE-seq：Pythiaキュレーション、Cellxgene
  ・プロテオミクス：CPTAC
  ・バルクRNA-seq：Recount3、GTEx、TCGA
  ・Visium：空間トランスクリプトミクス